CIRel sprovodi onlajn programe “Škola tolerancije - etničke i verske zajednice u periodu tranzicije“ kroz koje nudi polaznicima sticanje relevantnih znanja o društvenoj ulozi religije i verskih zajednica u Srbiji, na Balkanu i u savremenom svetu, o značaju i karakteru međureligijskih odnosa i tolerancije na Balkanu i šire, kao i o najaktuelnijim savremenim trendovima u ovom oblastima i njihovom postojećem ili potencijalnom uticaju na naše živote. “Škola tolerancije“ je onlajn obrazovni program u kome se, osim u slučajevima kada se održava i početni susret, cela nastava i komunikacija polaznika i predavača odvija preko interneta. Tokom 9 sedmica onlajn predavanja, polaznici obrađuju po jednu temu nedeljno, a sve aktivnosti se odvijaju na za tu priliku posebno izrađenom sajtu sa materijalima predavača, na kome se nalaze i odgovarajući interaktivni servisi - forum, čet soba i blog. Pored proučavanja nastavnih materijala, polaznici su obavezni da sa predavačima učestvuju u moderiranim debatama na internet forumu i u moderiranim čet debatama, kao i da izrade svoje blogove (svojevrsne lične prezentacije) u kojima iznose svoje poglede na teme programa.

Počevši od 2006. CIRel je organizovao tri onlajn programa na kojima se 85 polaznika iz Srbije i drugih zemalja Zapadnog Balkana upoznalo sa različitim aspektima verskog života zemlje i regiona, uz korišćenje informacionih tehnologija. Ciljevi ovih programa su bili da polaznike, društveno aktivne mlade ljude, poduče i informišu o društvenoj ulozi religije u procesu pomirenja, izgradnje mira, procesu sprečavanja i rešavanja konflikata, kao i o značaju razvoja međuetničkog i međureligijskog dijaloga i tolerancije.

Polaznici su bili mladi ljudi sa iskustvom u oblasti interreligijskog dijaloga, predstavnici verskih zajednica, teolozi, mirovni aktivisti i predstavnici drugih inicijativa građanskog društva, studenti, aktivisti političkih stranaka, novinari, zaposleni u državnoj upravi i sl. Prilikom prijema kandidata posebno se vodilo računa o podjednakoj zastupljenosti oba pola, kao i o ravnomernoj zastupljenosti polaznika iz različitih delova Srbije i regiona. CIRel je organizovao sledeće programe ove vrste: